Filtračný systém Podlahový vysávač zohráva rozhodujúcu úlohu pri prevencii sekundárneho znečistenia.
Vysokokvalitný filtračný systém Floor Vacuum Cleaner využíva viacero filtračných technológií. Bežné sú primárna filtrácia, čo je vo všeobecnosti filter alebo filtračná vata, ktorá dokáže odfiltrovať veľké častice prachu a nečistôt, ako sú vlasy, nečistoty atď. Toto je prvá línia obrany proti sekundárnemu znečisteniu. Napríklad primárny filter niektorých vysávačov dokáže efektívne zachytiť väčšie častice viditeľné voľným okom, čím sa zníži záťaž následných filtračných prepojení.
Ďalej je to vysokoúčinná filtračná vrstva, ako je HEPA. Dokáže presne odfiltrovať drobné prachové častice a účinnosť filtrácie pre častice s veľkosťou 0,3 mikrónu a viac môže byť až 99,97 % alebo dokonca vyššia. To znamená, že takmer všetok škodlivý prach nasatý do vysávača môže byť zachytený a nebude opäť vypustený do ovzdušia, čím sa zabráni znečisteniu vnútorného vzduchu a poškodeniu dýchacích ciest človeka.
Niektoré vysávače používajú aj filtračné vrstvy s aktívnym uhlím, ktoré dokážu absorbovať pachy a škodlivé molekuly plynov, ako je formaldehyd a benzén. Najmä pri čistení chlpov domácich zvierat, vlhkého prostredia alebo priestorov so zápachom dokáže vrstva filtra s aktívnym uhlím účinne odstrániť pachy, urobiť odsávaný vzduch sviežejším, ďalej zlepšiť čistiaci účinok a zabrániť sekundárnemu znečisteniu spôsobenému pachmi a škodlivými plynmi.
Okrem toho má filtračný systém niektorých špičkových podlahových vysávačov aj samočistiacu funkciu. Počas prevádzky vysávača sa prach na filtračnej sieťke včas čistí spätným prúdením vzduchu alebo vibráciami, pričom sa zachováva priepustnosť a filtračná účinnosť sieťky filtra a nedochádza k poklesu nasávania a sekundárneho znečistenia spôsobeného upchatím filtra. Napríklad niektoré vysávače s technológiou cyklónovej separácie dokážu počas procesu filtrácie oddeliť prach z filtračnej siete silnou odstredivou silou a hodiť ho do vedra na zachytávanie prachu, čím sa zabezpečí, že filtračný systém bude vždy udržiavať dobrý pracovný stav.